Virologi

Avdelinga har nasjonalt ansvar for overvaking av ei rekkje virusinfeksjonar, laboratoriediagnostikk, utbrotsoppklaring, resistensregel, måling av immunitet, vaksineoppfølging, forsking og rådgiving.

Ansvarsoppgåver

Avdeling for virologi er nasjonalt referanselaboratorium for følgjande virus: influensavirus (WHO referanselaboratorium), koronavirus med alvorleg utbrotspotensiale (SARS-CoV-2, MERS, og SARS), mesling- og rubellavirus), kusma, polio/enterovirus, TBE-virus (skogflåttencefalittvirus), rotavirus, og hepatitt A-, B-, C-, D- og E-virus. Avdelinga har i tillegg ansvar for laboratorieaktiviteten ved FHI knytta til HPV-vaksinasjonsoppfølgingsprogrammet. Fleire metodar er akkrediterte av Norsk akkreditering.

Avdelinga er involvert i internasjonale overvakingsnettverk og samarbeid under Verdens helseorganisasjon (WHO) og det europeiske smittevernbyrået ECDC. Avdelinga er også utpeika som nasjonalt referanselaboratorium av WHO for utrydding av vilt poliovirus i verda. Tilsvarande er avdelinga nasjonalt referanselaboratorium under WHO for utrydding av mesling- og rubellavirus i Europaregionen og er WHO sitt referanselaboratorium for Influensa i Noreg (WHO National influenza Centre (NIC-Norway)).

Kva arbeider avdelinga med?

Avdelinga får prøver til virusovervaking, diagnostikk, karakterisering og resistensbestemming. Resultata blir nytta i overvakinga av virusførekomst og viruseigenskapar, utbrotsoppklaring, diagnostiske avklaringar, for behandling og i samband med vaksineoppfølging.

Avdelinga utfører ei rekkje molekylærbiologiske analysar, under dette heilgenomsekvensering, cellekulturbaserte analysar, og serologiske analysar. Avdelinga driv forsking og analyse mellom anna knytta til førekomst av infeksjonar, virusvariantar, antiviralresistens, re-infeksjon- og vaksineproblematikk. Vidare jobbar avdelinga mykje med metodeutvikling knytt til referansefunksjonar og beredskap med satsing på heilgenomsekvensering. Drift av laboratorieinfrastruktur inngår også i arbeidsoppgåvene til avdelinga.

Avdelinga jobbar med eit større digitaliseringsprosjekt, delvis finansiert ved EU4Health for å styrkja og effektivisera laboratorieovervåkinga og beredskap med fokus på heilgenomsekvensering. Prosjektet er eit samarbeid med avdeling for bakteriologi (NOR-WGS: Forbetra infrastruktur for heilgenomsekvensering).

Kjernekompetanse

Avdelinga har høg fagkompetanse i virologi, både innan laboratorieanalysar og genomanalysar.

Avdelingar deltek i forskingsprosjekt, nasjonalt og internasjonalt, med fokus på studiar av endringar i førekomst og virusvariantar over tid, assosiasjon med forventa vaksine effekt, sjukdomsframkallande eigenskapar, resistens mot behandling m.m.

Målgrupper

Vi utfører primærdiagnostikk og referansediagnostikk innan referansefunksjonane våre avhengig av agens og tilpassar behovet til dei mikrobiologiske laboratoria og klinikarar i Noreg. Me gir råd om diagnostikk, og informasjon via nettsidene våre, laboratoriehåndboken, ulike rettleiarar som Vaksinasjonshåndboken, Smittevernhåndboken, behandlingsretningslinjer mm. Vi tilbyr

referansemateriale og lagar ringtestar i virologi og serologi for dei medisinsk mikrobiologiske avdelingane for å bidra til høg kvalitets av diagnostikk i Noreg.

Me rapporterer virusovervakingsdata nasjonalt, og internasjonalt, til ECDC og WHO, og bidreg til internasjonal pandemiberedskap i WHO og Pandemic Influenza Preparedeness (PIP) framework og dessutan deltek i treningsøvingar internasjonalt og workshops.

Seksjoner

Avdelinga er organisert i 4 seksjonar:

• Seksjon for Influensa og annen luftsmitte
• Seksjon for virus via blod, sex, og næringsmidler 
• Seksjon for MMR og virus infeksjoner i nervesystemet
• Seksjon for fellesfunksjoner og prøvemottak

Seksjon for influensa og andre luftveisvirus

Leiar: Karoline Bragstad, PhD, seniorforskar

Seksjonen har ansvar for overvaking av og beredskap for influensa, RSV og koronavirus med alvorleg utbrotspotensiale. Seksjonen har også referansefunksjon for desse og er nasjonalt influensa senter for WHO i Noreg (NIC-Norway)

Oppgaver

Seksjon for influensa og andre luftvegsvirus har tre nasjonale referansefunksjonar i medisinsk mikrobiologi, influensa, RSV og koronavirus med alvorleg utbrotspotensiale (til dømes SARS og MERS), og har ansvar for nasjonal overvaking, rådgiving og beredskap knytt til dette. Seksjonen utfører integrert overvaking av desse luftvegsinfeksjonane i global samanheng ved å vera nasjonalt influensasenter for WHO i Noreg (NIC-Norway) og nyttar seg av eit breitt spekter av metodar både innan molekylærbiologi og konvensjonell virologi inkludert serologi/immunologi.

Ein stor del av arbeidet i seksjonen baserer seg i dag på djuptgåande analysar av virus for å overvaka genetiske endringar for auka forståing av smittesituasjon, virus og sjukdom, og utbrot. Ei vesentleg oppgåve er å undersøkja korleis influensa og koronavaksinane passar med sirkulerande virus og korleis immunitet mot desse virusa endrar seg i befolkninga over tid.

Seksjonen rapporterer virologisk overvaking nasjonalt og internasjonalt til ECDC og WHO og er aktivt med i internasjonalt og nasjonalt overvakingsarbeid og har dessutan eit tett samarbeid med andre innan epidemiologisk overvaking, modellering og beredskap.

Seksjonen driftar den nasjonale sentinel fyrtårnovervakinga av luftvegsvirus i Noreg.

Skildring av kompetansen til seksjonen

Seksjonen har stor kompetanse innan virologi, på virologisk overvaking og pandemi beredskap i tillegg til å vera sterke på både molekylærbiologiske og immunologiske metodar. I tillegg til human virologi er seksjonen sterke på zoonotisk influensa, som fugleinfluensa.

Forsking/større prosjekt

Eigeninitiert forsking hovudsakleg knytt til viruseigenskapar, immunitet og overvaking, men deltek også i EU Joint Actions på overvaking, og er del av ECDC AURORA nettverket for laboratoriestøtte i EU for SARS-CoV-2 og influensa. Seksjonen driftar det nasjonale seroepidemiologi undersøkinga av restserum i Noreg som blir brukt til å undersøkja for befolkningsimmunitet over tid mot influensa og SARS-CoV-2 spesielt i Noreg.

Seksjon for virus via blod, sex og næringsmidler

Leiar: Kathrine Stene-Johansen, PhD, seniorforskar

Ansvarsområde

Seksjonen har referansefunksjon for rota- og hepatitt virus (A, B, C, D og E), og dessutan ansvar for den virologiske overvakinga av HPV vaksinen som inngår i barnevaksinasjonsprogrammet i Noreg.

Oppgåver

• Virologisk overvaking av HPV blir utført ved genotyping av innsamla biologiske materiale frå alderskohortar frå gutar og jenter, i samband med HPV-vaksinasjonsoppfølgingsprogrammet. Metodane som blir nytta til HPV-typing er Luminex-basert, heilgenomsekvensering og ulike typings PCRer.
• Diagnostikk og virologisk overvaking i samband med oppfølging av rotavirusvaksinen i barnevaksinasjonsprogrammet. Det blir nytta typespesifikk PCR for påvising av vaksinestamme. Det blir arbeidd med å utvikla NGS som ny metode for genotying av sirkulerande stammar i befolkninga.
• Innanfor referansefunksjon for hepatittvirusa blir tilbode primært analysar til påvising av HAV, HBV, HDV og HEV, og dessutan karakterisering av genotypar og antiviral resistens for oppfølging og behandling av kroniske hepatitt B og C infeksjonar. Vidare blir utført overvaking av HAV med tanke på utbrotsoppklaring, og dessutan overvaking av antiviral resistens for HBV og HCV.

Kompetansen til seksjonen

Seksjonen har høg kompetanse innan virologi, diagnostikk og metodeutvikling og utføring både serologiske og ei rekkje molekylære analysar, under dette Luminex teknologi, PCR, Sanger sekvensering, heilgenomsekvensering, og dessutan tolking og analyse av laboratorieresultater inklusiv bioinformatikk.

Forsking/større prosjekt

Seksjonen er involvert i forsking som støttar opp under referansefunksjonane og samfunnsoppdraget til instituttet ved å studera førekomst av infeksjon, virusvariantar, mutasjonar og resistens i tilknyting til overvaking, spesielle kasuistikkar og kliniske studiar knytt til behandling av kroniske hepatitt infeksjonar. Vidare blir det utført forsking for å sjå på effekten av vaksine, og dessutan forsking innan HPV-feltet i samarbeid med Kreftregisteret på biomarkørar for sjukdomsprogresjon.

Seksjon for MMR og virusinfeksjoner i nervesystemet

Leiar: Aina Fossum Moen, PhD, Seniorforsker  

Ansvarsområde

Seksjonen har referansefunksjon for MMR, TBE og polio/enterovirus. Seksjonen fokuserer på overvaking og forsking knytt til virusa som forårsakar MMR (Meslingar, Kusma, Røde hundar), TBE (Tick-borne encephalitis) og polio- og enterovirus. Me har ei nøkkelrolle i å overvaka spreiinga og utviklinga til desse virusa. Polio-laboratoriet i seksjonen er utpeika som nasjonalt referanselaboratorium av Verdshelseorganisasjonen (WHO) for utrydding av vilt poliovirus i verda. Tilsvarande er avdelinga nasjonalt referanselaboratorium under WHO for utrydding av mesling- og rubellavirus i Europaregionen

Oppgaver

• Overvake og analysera utbrot og smittespreiing av MMR, TBE og enterovirus. Deteksjon og karakterisering av enterovirus frå barn under 15 år med akutte, slappe lammingar
• Diagnostikk av TBE tilfelle, og kartlegging av utbreiing av TBE virus i flått i Noreg
• Samarbeide med nasjonale og internasjonale helseorganisasjonar

Seksjonens kompetanse

Vår seksjon er spesialisert på MMR (Meslingar, Kusma, Røde hundar), TBE (Tick-borne encephalitis), og Polio/enterovirus. Med eit team av høgt kvalifiserte ingeniørar og forskarar, er me dedikerte til å forstå og nedkjempa desse sjukdommane. Ekspertisen vår omfattar avansert diagnostikk, overvaking av virus, utvikling av metodikk og bidrag til utbrotsoppklaring.

Forsking/større prosjekt

Seksjonen vår er engasjert i ein omfattande forskingsaktivitet på TBE (Tick-borne encephalitis) virus. Me leier og deltek i fleire prosjekt i samarbeid med nordiske land for å kartleggja TBEV utbreiing i flått i Noreg og over landegrensene, med tanke på vaksinasjon. Seksjonen samarbeider med det forskings EINPEN (Europeisk non-polio-enterovirus)-nettverket.

Seksjon for fellesfunksjoner og prøvemottak

Leiar: Mythili Manoharan, BSc

Ansvarsområde

Seksjonen har ansvar for bestilling av varer til avdeling for virologi, og mottak av varer til fleire laboratorieavdelingar ved FHI, og dessutan for drift av noko av laboratorieinfrastrurkturen.

Prøvemottaket har ansvar for mottak av prøver og utsending av analysesvarbrev til rekvirentar.

Oppgåver

Mottak av biologiske prøvemateriale, utpakking,sortering og . registrering av prøver til avdelinga. i laboratoriesystemet LabWare.

• Betening av telefonar, både prøvemottak, varemottak og vakttelefon til legane i avdeling for virologi-
• Utskrift og utsending av svarbrev.
• Bestilling av nødvendige varer til laboratoriedrift og kontor rekvisita. Mottak og sortering av varer.

Kompetansen til seksjonen

Seksjonen har god kompetanse innan logistikk, instrumentasjon og prøvehandtering.

Forsking/større prosjekt

Det går føre seg eit større prosjekt om elektronisk kommunikasjon med rekvirerande laboratorium.