JanusRNA - identifisering av tidlige biomarkører for kreft

Kreftforekomst og diagnostikk

Omtrent 38 000 nordmenn får en kreftdiagnose hvert år, og kreft er samlet sett den ledende dødsårsaken i Norge. Brystkreft og prostatakreft er de vanligste kreftformene hos henholdsvis kvinner og menn, etterfulgt av tykk- og endetarmskreft samt lungekreft hos begge kjønn.

Overlevelsen ved de fleste kreftformer er i stor grad avhengig av hvilket stadium kreften er i ved diagnosetidspunktet. Metoder som kan oppdage kreft på et tidlig stadium og dermed forbedre overlevelsen, er derfor av stor betydning. Det overordnede målet med dette prosjektet er å undersøke mikroRNA (miRNA) og andre sirkulerende RNA som potensielle tidlige biomarkører for kreft.

RNA-data

Vi har produsert RNA-sekvenseringsdata fra serumprøver tatt før kreftdiagnose fra Janus serumbank-kohorten. Vi har inkludert pasienter med lungekreft (n=404), tykktarmskreft (n=305), endetarmskreft (n=190), brystkreft (n=205), prostatakreft (n=326), eggstokkreft (n=80), testikkelkreft (n=80) og galleblærekreft (n=27). Prøvene ble samlet inn inntil 10 år før kreftdiagnosen. I tillegg har vi inkludert en stor frekvensmatchet kontrollgruppe bestående av 673 kreftfrie personer, med oppfølging i inntil 10 år etter blodprøvetaking. Vi har også produsert data fra pasienter med livmorkreft og tilhørende matchede kontrollpersoner (n=320/320).

Prosjektet er initiert og ledes av Kreftregisteret og gjennomføres i nært samarbeid med Norsk senter for sekvensering ved Oslo universitetssykehus/Universitetet i Oslo. Vi har utviklet og optimalisert en metode for RNA-sekvensering av prøver med lav mengde RNA.

Sekvenseringsdataene kombineres med detaljert informasjon om kreft fra Kreftregisteret og informasjon om miljøeksponeringer fra helseundersøkelser. Dataene analyseres ved hjelp av avanserte bioinformatiske metoder.

Hvordan få tilgang til data

I dette prosjektet har vi hatt et tett samarbeid med ELIXIR/NFEGA for å utvikle mekanismer for deling av FAIR-data, og vi har etablert en komité for tilgang til data (Data Access Committee).

Alle forskningsprosjekter som omfatter opplysninger og/eller biologisk materiale fra Janus serumbank, krever etisk forhåndsgodkjenning fra Regional Etisk Komite (REK), og må i tillegg ha lovlig behandlingsgrunnlag etter personvernforordningen (GDPR) artikkel 6 og artikkel 9. Søker må også har vurdert behov for personvernkonsekvensvurdering etter GDPR artikkel 35. Søker må godtgjøre at kravene er oppfylt før data kan gjøres tilgjengelige. Utlevering av opplysninger og/eller biologisk materiale til tredjestater forutsetter at vilkårene i GDPR er oppfylt. For mer informasjon kontakt oss på mirJanus@fhi.no.

For å søke om tilgang til publiserte data fra JanusRNA studien må søkeren fylle ut dette skjemaet:

• Søknadsskjema for datatilgang JanusRNA 

Finansiering

• Forskningsrådet, Kreftforeningen, Den europeiske union

Samarbeidspartnere

• Norsk Sekvenseringssenter og Universitetet i Oslo
  Kjernefasilitetsleder, Robert Lyle, PhD
• Saarland Universitet
  Chair of Clinical Bioinformatics, Andreas Keller, PhD
  Institute of Human Genetics, Eckart Meese, PhD
• Institutt for Kreftforskning ved Oslo Universitetssykehus
  Institutt for Tumorbiologi og forskningsgruppen for biomedisinsk informatikk, Prof. Eivind Hovig, PhD
  Institutt for Onkologi, Assoc. Prof Åslaug Helland, MD, PhD
• OsloMet – storbyuniversitetet
  Fakultet for helsevitenskap, Trine B. Haugen, PhD
• Universitet i Heidelberg
  Medisinsk Biometri, Prof. Justo Lorenzo Bermejo, PhD
• German Cancer Research Centre
  Institusjonen for Kreftepidemiologi, Prof. Rudolf Kaaks, PhD
  Institusjonen for Kreftepidemiologi, Renée Fortner, PhD
• Harvard Medical School
  Brigham And Women’s Hospital, Prof. Kevin Elias, MD
• Imperial College London, School of Public Health
  Chair of Environmental Epidemiology, Prof. Paolo Vineis, MD, MPH, FFPH
  Epidemiology & Biostatistics, Verena Züber, PhD
  Epidemiology & Biostatistics, Prof. Marc Chadeau-Hyam, PhD
• Universitet i Bergen
  Institutt for global helse og samfunnsmedisin, Prof. Tone Bjørge, MD, PhD, Prof. Rolv Terje Lie, PhD

Kontaktinformasjon

• E-post: mirJanus@fhi.no