Chipanalyse av single nucleotid polymorphismer

Sammendrag

Studier av genetisk variasjon i det humane genomet kan gi ny kunnskap om utvikling av kreft.Prosjektet planlegges som en forstudie hvor formålet er å undersøke kreftrelaterte SNPer (generell kreftrisiko) i prøver fra Janus serumbank, ved hjelp av chipanalyse av som håndterer lave konsentrasjoner av DNA. Vi vil sammenlikne flere teknologier for å avgjøre hvilken som gir høyest data kvalitet og som kan automatiseres for store studier.Vi vil rapportere om frekvens av vellykkede SNP identifiseringer per probe og totalt antall per prøve. Prosentvis antall prøver som har vellykked identifisering av over 95% av SNPene, en vanlig brukt standard, vil indikere brukbarheten av cohorten i slike studier.