Seksjonen gir råd om førebyggande tiltak, gir informasjon og råd om vaksinasjon, og følger opp barnevaksinasjonsprogrammet. Seksjonen overvaker førekomsten av luftbårne - og vaksineforebyggbare infeksjonar, og dekker mikrobiologiske referansefunksjonar.

Seksjonen analyserer overvakingsdata og driv forskingsprosjekt for å skaffe ny kunnskap om bruk og effekt av vaksinar, og om sjukdomar som kan førebyggast ved vaksinasjon.