Hopp til innhold
Lukk

Få varsel ved oppdateringer av «Tarmpatogene E.coli»

Hvor ofte ønsker du å motta varsler fra fhi.no? (Gjelder alle dine varsler)
Ønsker du også varsler om:

E-postadressen du registrerer her vil kun bli brukt til å sende ut nyhetsvarsler du har bedt om. Du kan når som helst avslutte og slette din e-postadresse ved å følge lenke i varslene du mottar.
Les mer om personvern på fhi.no

Du har meldt deg på nyhetsvarsel for:

  • Tarmpatogene E.coli

Oops, noe gikk galt...

... ta kontakt med nettredaksjon@fhi.no.

... last inn siden på nytt og prøv igjen.

Tarmpatogene E.coli

Publisert

FHI har referansefunksjon for tarmpatogene E.coli.

FHI har referansefunksjon for tarmpatogene E.coli.


FHI har referansefunksjon for tarmpatogene E.coli; eae-positive E. coli (atypisk enteropatogen E. coli [aEPEC] eller EHEC-lost shigatoksin [EHEC-LST]), typisk EPEC (tEPEC), enteroinvasiv E. coli (EIEC), enterotoksigen E. coli (ETEC) og enteroaggregativ E. coli (EAEC).

Hensikten er å bidra til nasjonal epidemiologisk overvåking, utbruddsetterforskning, forebygging og bekjempelse av tarmpatogene E. coli-infeksjoner. Infeksjoner med tarmpatogene E. coli er meldingspliktig til MSIS.

Alle kliniske førstegangsisolater av tarmpatogene E. coli sendes som renkultur til FHI. Kriterier for innsending av eae-positive E. coli er angitt i Strategimøte nr. 29, 2015 og kun unntaksvis kan blandingskultur av eae-positiv E. coli innsendes. Isolater som påvises ved eventuelt sykdomsresidiv mindre enn 3 måneder etter siste positive prøve skal ikke sendes inn med mindre det foreligger grunn til å mistenke reinfeksjon.  

Renkulturer av isolatene skal sendes inn sammen med utfylt rekvisisjonsskjema.

Alle innsendte tarmpatogene E. coli-isolater verifiseres og helgenomsekvenseres for å kartlegge virulensgener (patogrupper), serotype, sekvenstype (ST) og klustertype (CT) med tanke på molekylærepidemiologisk overvåking. ST og CT bestemmes ved multilokus sekvenstyping (MLST) [1] og kjernegenom MLST [2].

Referanser

  1. Wirth T, Falush D, Lan R, Colles F, Mensa P, Wieler LH, Karch H, Reeves PR, Maiden MC, Ochman H, Achtman M. (2006). Sex and virulence in Escherichia coli: an evolutionary perspective. (Mol Microbiol. 60(5):1136-51). coli MLST Warwick (EnteroBase)
  2. Escherichia/Shigella cgMLST v1 scheme for EnteroBase (EnteroBase) kjørt i SeqSphere+(Ridom SeqSphere+).