Hopp til innhold

Valgte elementer er lagt i handlekurven

Gå til handlekurv

MoBa Genetics - Genetiske data fra den norske Mor og barn undersøkelsen (MoBa)

Publisert


MoBa Genetics er en forskningsinfrastruktur som har som mål å genotype alle deltakerne i MoBa, og gi tilgang til disse dataene gjennom en sikker plattform til godkjente forskningsprosjekter.


Det overordnede målet for MoBa Genetics er å genotype alle tilgjengelige DNA-prøver fra deltakere i Norsk mor- og barn kohortstudien (MoBa), og videre å gjøre disse genetiske dataene tilgjengelige for forskningsprosjekter. Per i dag vil all tilgang til dataene bli gitt gjennom Tjenestene for sensitiv data (TSD) ved Universitetet i Oslo.

MoBa tar imot søknader om tilgang til MoBa Genetics-infrastrukturen for å svare på spesifikke vitenskapelige mål. Før du søker om tilgang til MoBa Genetics, vennligst les informasjonen nedenfor. Kontakt MoBa-administrasjonen dersom ytterligere informasjon er nødvendig.

Den norske mor og barn-undersøkelsen

MoBa er en prospektiv befolkningsbasert graviditets-kohortstudie utført av Folkehelseinstituttet. Deltakere ble rekruttert fra hele Norge i perioden 1999-2008. Kvinnen samtykker til deltakelse i 41% av svangerskapene. Kohorten inneholder nå 285 000 deltakere. DNA-prøver er tilgjengelig fra 239 000 deltakere eller 59 000 komplette trioer (mor, far og barn).

Generell informasjon om helse og eksponering samles inn ved bruk av spørreskjema fra graviditeten og framover. Biologisk materiale er også samlet fra deltakerne. Blodprøver ble tatt fra begge foreldrene under graviditeten og fra mor og barn (navlestreng) ved fødselen.

Genotyping av MoBa

Genotypingen av MoBa-prøvene er et samarbeidsprosjekt, utført hovedsakelig i tre forskningsprosjekter, samt flere mindre prosjekter. De tre hovedprosjektene er:

HARVEST - Per Minor Magnus, FHI og Pål Njølstad, UiB (Prosjektledere)

  • 33 000 prøver (11 000 trioer)
  • Analysert på Illumina HumanCoreExome ved Genomics Core Facility Trondheim
     

ERC (HARVEST) - Pål Njølstad, UiB (Prosjektleder)

  • 27 000 prøver (9 000 trioer)
  • Analysert på Illumina Global Screening Array ved ERASMUS MC

NORMENT - Ole Andreassen, UiO/OUS (Prosjektleder)

  • 90 000 prøver (26 000 trioer)
  • Analysert på Illumina OmniExpress ved deCODE  

De ovennevnte prosjektledere (Per Minor Magnus, Pål Njølstad and Ole Andreassen) skal, frem til 2025, inviteres til å delta i ethvert prosjekt som bruker disse genetiske dataene. MoBa forventer at alle forskere følger retningslinjene fra Vancouver-konvensjonen om forfatterskap. Antall samarbeidspartnere og forfatterskap bør avklares før prosjektet starter.

MoBa Genetics

Følgende prøver er tilgjengelige i infrastrukturen MoBa Genetics per i dag:

HARVEST- Per Minor Magnus, FHI og Pål Njølstad, UiB (Prosjektledere)

  • 33 000 prøver (11 000 trioer)
  • Analysert på Illumina HumanCoreExome ved Genomics Core Facility Trondheim  

Etter at Forskrift om befolkningsbaserte helseundersøkelser trådde i kraft 13.08.2018 kan alle data og analyseresultater tilbakeføres til MoBa (§ 5-1) uten ytterligere godkjenning fra Regional komite for medisinsk og helsefaglig forskningsetikk (REK). Analyser av opplysninger eller humant biologisk materiale fra undersøkelsen skal derfor kunne tilbakeføres, lagres og gjenbrukes i MoBa (jf. pkt. 3.10). Derfor kan genetiske data fra ulike prosjekter utgått fra MoBa kunne tilbakeføres til MoBa - og da ikke bare kunne lagres, men også gjenbrukes. Listen ovenfor blir oppdatert når nye prøver legges til i infrastrukturen. Ethvert prosjekt som har tilgang til MoBa Genetics, vil ha tilgang til alle, til enhver tid, kvalitetskontrollerte genetiske data i infrastrukturen.

MoBa må sikre at dataene i infrastrukturen er av høy kvalitet. En gruppe forskere, som tidligere har erfaring med kvalitetskontroll (QC) har utført QC på det første datasettet som er nevnt ovenfor.

Datasettet i MoBa Genetics består av følgende:

  • Rådata direkte fra skanneren (.idat)
  • Rådata eksportert fra GenomeStudio
  • Kvalitetskontrollerte data
  • Ytterligere dokumentasjon vedrørende prøvene og datasettet

Mer informasjon om datasettet, hvilke filer som er tilgjengelige og hvordan kvalitetskontrollen ble utført, er tilgjengelig på forespørsel eller ved tilgang til infrastrukturen.

Tilgang til MoBa spørreskjema data vil bli gitt til prosjektleder i hvert forskningsprosjekt basert på formålet med studien.

Hvem kan søke om tilgang?

Enhver forskningsgruppe med prosjektleder som er tilknyttet et norsk forskningsinstitutt kan søke om tilgang til MoBa spørreskjemadata og/ eller genetiske data. Dette innebærer at forskergrupper fra andre land må finne en samarbeidspartner i Norge for å kunne få tilgang til MoBa-data. Prosjektleder må ha forskningserfaring, normalt doktorgrad.

Alle prosjekter må ha godkjennelse fra Regional komite for medisinsk
og helsefaglig forskningsetikk i Norge (REK) og overholde EUs personvernforordning (GDPR). Prosjektet må også etablere et prosjektområde på Tjeneste for sensitiv data (TSD) ved Universitetet i Oslo. Andre godkjenninger kan gjelde.

Kostnad for tilgang til MoBa Genetics

Kostnaden for tilgang til MoBa Genetics er beregnet ut fra kostnadene til utvikling og forvaltning av infrastrukturen samt lagring og kvalitetskontroll av dataene. Prisen kan endres når MoBa Genetics er fullført og en permanent infrastruktur og administrasjonsmodell er på plass.

Ved planlegging av et nytt forskningsprosjekt basert på MoBa ber vi om at det tas høyde for kostnader knyttet til tilgang til data og biologisk materiale. 

Prisliste for MoBa

Prisene i denne listen kan endres på kort varsel. Den gjeldende prisen vil være den som settes opp i kontrakten mellom MoBa og prosjektet, eller som er fastsatt i et vedtaksbrev. 

Inkludert i prisene er tilgang til alle genetiske data fra MoBa Genetics som til enhver tid er kvalitetssikret og tilgjengeliggjort. Prosjektrom på TSD og brukerstøtte er ikke inkludert i prisen.

MoBa forventer at prosjektgruppen innehar den nødvendige kompetansen for å analysere dataene.

Hvordan søke om tilgang

Søknadsprosessen for tilgang til MoBa Genetics er beskrevet nedenfor. Trinnene i figuren er beskrevet mer detaljert under figuren. PI er ansvarlig for det som skjer i de blå boksene. MoBa-administrasjonen eller MoBa-dataenheten er ansvarlig for det som skjer i de oransje boksene.

Søknadsprosess:

  1. Prosjektleder (PI) samler alle nødvendige dokumenter. Disse må være på engelsk:
    • Godkjennelse (REK eller lignende)
    • Finansiering
    • Personvernskonsekvensutredning (DPIA)
    • MoBa variabel-skjema hvis nødvendig
  2. PI sender søknaden, inkludert nødvendige dokumenter, med det elektroniske søknadsskjemaet til FHI.
  3. MoBa-administrasjonen vurderer alle nye søknader en gang per måned.
  4. Dersom søknaden er ufullstendig eller noe er uklart, ber MoBa-administrasjonen om ytterligere opplysninger eller dokumentasjon.
  5. PI oppdaterer søknaden ved å svare til mobaadm@fhi.no. MoBa-administrasjonen vurderer deretter søknaden på nytt.
  6. Dersom søknaden avslås, sendes et avslagsbrev til PI. PI kan revidere søknaden og sende på nytt hvis ønskelig.
  7. Dersom søknaden blir godkjent, sendes Data Access Agreement (DAA) til PI for signering.
  8. PI må etablere et TSD-prosjektområde ved UiO:
    • Hvis prosjektet ikke har en TSD-konto, må PI søke om dette på UiO.
    • Hvis prosjektet allerede har en TSD-konto, trenger man ikke foreta seg noe.
  9. PI sender en signert kopi av DAA til mobaadm@fhi.no i tillegg til følgende dokumenter:
    • Form2, ferdig utfylt
    • Fakturainformasjon
    • Navn (PXXX) på TSD-området
    • Utløpsdato for TSD-området
    • Navn og e-postadresse for TSD-områdets administrator
  10. MoBa-administrasjonen vurderer dokumentene og innsendte opplysninger.
  11. MoBa-data (MorBarnData@fhi.no) informerer PI om når man skal forvente tilgjengeliggjøring av fenotypiske data (spørreskjemadata) og eventuelt andre datafiler. MoBa-data ber TSD gi tilgang til MoBa Genetics til PI. Når tilgang er gitt vil PI og/eller prosjektets TSD-administrator få beskjed.
  12. Dersom ytterligere informasjon eller dokumentasjon er nødvendig før tilgjengeliggjøring av data vil MoBa-administrasjonen eller MoBa-data kontakte PI direkte.
  13. Prosjektet har tilgang til MoBa Genetics og eventuelle fenotypiske data og kan dermed starte.

Kontaktinformasjon

For mer informasjon eller ved spørsmål, vennligst kontakt MoBa administrasjonen: